Nors izopropanolį ir etanolį izopropanolį sudaro anglis, vandenilis ir deguonis, jų molekulinės struktūros skiriasi. Izopropanolio molekulinė formulė yra CH3CH2CH2OH, todėl jis yra prisotintas trijų- anglies organinių junginių, o etanolio izopropanolio molekulinė formulė (CH3)2CHOH, todėl jis yra organinis junginys, turintis vieną chiralinį anglies atomą.
Virimo temperatūra skiriasi: izopropanolis verda 97,2 laipsnio, o etanolio izopropanolis – 82,4 laipsnio. Kambario temperatūroje izopropanolis yra bespalvis, skaidrus skystis, o etanolis yra šviesiai geltonas skystis.
Tirpumas skiriasi: dėl skirtingos molekulinės struktūros izopropanolis ir etanolis tirpsta skirtingai. Izopropanolio tirpumas vandenyje yra 10,6 % (pagal tūrį), o etanolio izopropanolio tirpumas yra didesnis ir siekia 50 % (pagal tūrį).
Rūgštingumas / balansas: ir izopropanolis, ir etanolis yra alkoholiai, turintys vidutinį rūgštingumą ir galintys sukelti bazines{0}}katalizuojamas reakcijas.
